Игнорировать сингатуру в Clamav можно создав файл local.ign2 и добавив в него собственно название сигнатуры.
echo "Signature" >> /var/lib/clamav/local.ign2
затем перезапускаем clamav.
Пример, сегодняшний косяк с блокировкой doc файлов
echo "Win.Exploit.CVE_2016_3316-1" >> /var/lib/clamav/local.ign2