Чтоб apt смог юзать инет через проксю прописываем в /etc/apt/apt.conf
Acquire::http::Proxy "http://домен\логин:пароль@ip:порт";
Acquire::https::Proxy "http://домен\логин:пароль@ip:порт";
Acquire::ftp::Proxy "http://домен\логин:пароль@ip:порт";
Так же можно прописать в .bashrc
export http_proxy=http://домен\\логин:пароль@ip:порт;
export ftp_proxy=http://домен\\логин:пароль@ip:порт;