Обнаружился непонятный баг в работе conky. С параметром own_window_type normal, в файле .conkyrc, наблюдается сдвиг фонового изображения
Если изменить параметр на own_window_type override или own_window_type desktop фоновое изображение показывается нормально, без сдвигов. Однако при включении компьютера получается так, что обои рабочего стола загружаются позже conky, тем самым его перекрывая. Поэтому решил увеличить время загрузки conky, чтобы сперва грузились обои и только потом уже conky. Помогла команда sleep.
sh -c 'sleep 30s && conky'
Т.е. именно ее указал в «Система — Параметры — Запускаемые приложения»